Приклади розв'язування задач з молекулярної біології
Приклад №1
Некодуючий ланцюг ДНК має таку будову:
ТГГ – ТЦГ – ААА – ДАА – ТГЦ
А) амінокислотний склад кодованого білка цією ДНК
Б) антикодони
В) довжину відповідного гена
г) масу гена.
Розв'язання
У задачі чітко сказано, що ми маємо некодуючий ланцюг ДНК, тому спочатку знаходимо кодуючий (за принципом комплементарності Чаргаффа), з якого інформацію буде переписувати іРНК:
ДНК (к): АЦЦ - АГЦ - ТТТ - ЦТТ - АЦГ
іРНК: УГГ – УЦГ – ААА – ДАА – УГЦ
Тепер беремо таблицю генетичного коду і знаходимо послідовність амінокислот у білку:
білок: три - сір - ліз - глу - цис
Маючи іРНК, можемо тепер знайти антикодони тРНК:
Б) тРНК: АЦЦ, АГЦ, УУУ, ЦУУ, АЦГ (кому між антикодонами ставимо з тієї причини, що це окремі молекули, а не як іРНК – одна)
В) щоб визначити довжину гена, рахуємо кількість нуклеотидів ДНК (АЛЕ ТІЛЬКИ В 1 ЛАНЦЮЗІ, бо вони йдуть антипаралельно разом) і множимо на 0,34 нм (відстань між 2 сусідніми нуклеотидами):
15 * 0,34 нм = 5,1 нм (довжина гена)
Г) для маси гена необхідно знати кількість нуклеотидів (у 2 ланцюжках ОБОВ'ЯЗКОВО) і помножити на масу 1 нуклеотиду:
30*345 = 10345 (маса гена)
Приклад №2
Відносна молекулярна маса білка – 68 400. Визначте довжину і масу гена, що кодує цей білок.
Розв'язання
Щоб знати масу чи довжину гена, перш за все потрібно знати кількість у ньому нуклеотидів. Можна їх знайти, знаючи кількість амінокислот:
68 400 : 100 = 684 амінокислот (ділимо на 100, оскільки це маса 1 амінокислоти)
Коли ми шукаємо амінокислоти, то беремо для цього таблицю генетичного коду та комбінуємо 3 нуклеотиди іРНК. Тому
684*3 = 2052 нуклеотиди (іРНК)
А ДНК, на відміну від іРНК, має 2 ланцюги, тому:
2052 * 2 = 4104 нуклеотиди (ДНК, 2 ланцюги)
Тепер, знаходимо масу:
4104*345 = 1415880
І довжину (пам'ятаємо, що для довжини ми беремо лише кількість нуклеотидів в 1 ланцюгу)^
2052 * 0,34 нм = 697,68 нм (довжина гена)
Приклад №3
Фрагмент одного з ланцюгів молекули ДНК має такий нуклеотидний склад: ГГЦААТГЦАТ. Яке кількість водневих зв'язків утворюється між нуклеотидами наведеного фрагмента? Скільки даний фрагмент ДНК має фосфодієфірних зв'язків?
Розв'язання
Згадаймо, що водневі зв'язки виникають між комплементарними нуклеотидами 2 ланцюгів. Тому дописуємо 2 ланцюги ДНК і враховуємо, що між аденіном і тиміном є 2 зв'язки, а між гуаніном і цитозином - 3:
ГГЦААТГЦАТ
ЦЦГТТАЦГТА
3 3 32 22 3 3 2 2
Додаємо: 25 водневих зв'язків
Фосфодієфірні зв'язки є між сусідніми нуклеотидами у межах шкіри.
1 ланцюг має 10 нуклеотидів, а отже фосфодієфірних зв'язків у ньому - 9, а оскільки ДНК має 2 ланцюги, тому їх буде - 18.
Приклад №4
Фрагмент молекули ДНК містить 23% гуанілових нуклеотидів. Визначте (у відсотках) вміст інших нуклеотидів у наведеному фрагменті молекули ДНК.
Розв'язання
За правилом комплементарності можна сказати, що якщо Г = 23%, то і Ц = 23%
Разом: Р+Ц = 23% + 23% = 46%
Отже, на А і Т припадає: 100% - 46% = 54%
А = Т = 54%: 2 = 27%
Приклад №5
Довжина фрагмента ДНК – 510 нм. Визначити кількість азотистих основ іРНК. Скільки годин триватиме синтез білка на рибосомі?
Розв'язання
Знаючи довжину гена, можна визначити скільки в ньому є нуклеотидів:
510 : 0,34 нм = 1 500 нуклеотидів (ЛИШЕ В 1 ЛАНЦЮЗІ)
Отже, іРНК теж має 1500 нуклеотидів (у ній є 1 ланцюг)
Згадаймо, що кожен нуклеотид має 3 компоненти (пенотозу, фосфатний залишок та азотисту основу). Отже, в 1 нуклеотиді є 1 азотиста основа.
Тому іРНК має 1500 азотистих основ.
1 Амінокислоту кодує триплет іРНК. Визначаємо кількість амінокислот (їх у 3 рази менше, ніж нуклеотидів в іРНК):
1500: 3 = 500 амінокислот
Час синтезу білка: 500 * 0,2 с = 100 секунд
Сподіваюся, що ця стаття для вас була інформативною та корисною.
Немає коментарів:
Дописати коментар